یکی دیگر از شاخه های محیط زیست که در دانشگاه های برتر آمریکا و کانادا مورد توجه است بحث اکولوژی ایزوتوپهای پایدار Ecology of Stable Isotope می باشد.
ایزوتوپهای پایدار نقش اساسی در مطالعات بیولوژیکی و اکولوژی دارند.
این عناصر قادر به ردیابی تغییرات و فرایندهای رخ داده در طی زمان در سیستمهای بیولوژیکی هستند.
در میان ایزوتوپهای اکسیژن و هیدروژن از اهمیت ویژه ای برخوردار هستند.